بررسی مولکولی جمعیت ماهی کیلکای معمولی (Clupeonella cultriventris) در حوضه جنوبی دریای خزر به روش PCR - RFLP

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان

1 ساری

2 تهران

چکیده

 



در این بررسی 100 عدد ماهی کیلکای معمولی از حوضه جنوبی دریای خزر (50 عدد از منطقه امیرآباد در استان مازنداران و 50 عدد از منطقه بندر انزلی در استان گیلان) جمع آوری گردید. DNA با روش فنل - کلوفرم از بافت باله ماهی استخراج شد. واکنش PCR با استفاده از یم جفت پرایمر از توالی نوکلوئیدهای ناحیه D-Loop مولکول mtDNA انجام شد که در نتیجه آن محصول PCR در کلیه نمونه ها حدود 1015 جفت باز بدست آمد. جهت هضم آنزیمی محصول PCR از 13 آنزیم مورد استفاده، 5 آنزیم (Nda II، Mae III، Msp I، Hae III، Acy I) الگوهای پلی مورفیک را نشان دادند که در نتیجه آن 9 هاپلوتیپ مختلف بدست آمد. فاصله ژنتیکی بین هاپلوتیپها از 0.0073 تا 0.0369 متغیر بود. میانگین عددی تنوع هاپلوتیپ ها 0.7339±0.00068 و تنوع نوکلوتیدی 0.0000±0.0098 بود. همچنین اختلاف نوکلوتیدی بین جمعیت ها 0.01 درصد بود.
بر اساس نتایج حاصله و آنالیز آماری داده ها، تفاوت بین هاپلوتیپها معنی دار بود ((P?0.01 و بنابراین می توان گفت ساختار ژنتیکی متفاوتی بین دو منطقه نمونه برداری مشاهده گردیده است.

کلیدواژه‌ها


عنوان مقاله [English]

THE PCR-RFLP INVESTIGATION OF CLUPEONELLA CULTRIVENTRIS FROM THE SOUTH CASPIAN SEA, IRAN

نویسندگان [English]

  • F. Laloei 1
  • S. Rezvani 2
  • M. Nayerani 1
  • M. Taghavi 1
1 sari
2 tehran
چکیده [English]

Fifty common kilka (Clupeonella cultriventris) specimens from Guilan Province and fifty others from MazandaranProvinceSouth Caspian Sea were collected to study genetic variation in the fish using Restricted Fragment Length Polymorphism (RFLP) of the mtDNA. DNA was extracted from fin tissue by phenol-chloroform method. The PCR products were digested using 13 restriction endo-nuclease enzymes. Five out of thirteen restriction enzymes were polymorphic resulting in nine different haplotypes. The haplotype divergence ranged from 0.0073 to 0.0369. The mean value of haplotype and nucleotide diversity among populations was 0.7339±0.0006 and 0.0098±0.0, respectively. The nucleotide divergence among populations was 0.01%. Statistically significant differences in haplotype frequencies among all samples were observed (P<0.01). Therefore, we conclude the populations are different genetically.

کلیدواژه‌ها [English]

  • Kilka
  • CLUPEONELLA CULTRIVENTRIS
  • PCR- RFLP
  • SOUTH CASPIAN SEA
  • Iran