بررسی مولکولی جمعیت شانه دار دریای خزر به روش RAPD

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان

چکیده

به منظور تعیین ساختار ژنتیکی جمعیت شانه دار دریای خزر (Mnemiopsis leidyiتعداد 200 نمونه شانه دار از نواحی جنوبی دریای خزر (سواحل گیلان، مازندران و گلستان) و شمالی آن (آبهای روسیه) جمع آوری گردید. استخراج DNA با بهینه سازی روش فنل- کلروفرم انجام شد، بطوریکه غلظت آن در کلیه نمونه ها 50 تا 100 نانو گرم بود. جهت انجام آنالیزRAPD از 19 پرایمر استفاده شده و کلیه نمونه ها همراه با نشانگر 50 pb DNA روی ژل آگارز 1 درصد الکتروفورز گردیدند. تجزیه و تحلیل داده ها و آنالیز آماری با استفاده از نرم افزار POPGENE صورت گرفت. پس از انجام الکتروفورز، 10 پرایمر از 19 پرایمر، الگوهای باندی چند شکلی را نشان دادند. بر اساس تجزیه و تحلیل داده ها، میانگین تنوع ژنتیکی در مناطق نمونه برداری 0.189 بود و بیشترین تنوع در ناحیه شمالی دریای خزر مشاهده شد. همچنین بیشترین فاصله ژنتیکی بین نمونه های ناحیه شمالی و سواحل گلستان (0.089) و کمترین آن بین سواحل مازندران و گیلان دیده شد. علاوه بر این بیشترین میانگین میزان شاخص شانن در نمونه های ناحیه شمالی دریای خزر مشاهده گردید (0.001). ترسیم نمودار شجره ای نمونه ها نشان داد که نمونه های سواحل مازندران، گیلان و گلستان در یک شاخه و نمونه های ناحیه شمالی دریای خزر در شاخه جداگانه قرار دارند. همچنین تنوع ژنتیکی مشاهده شده بین نمونه های ناحیه شمالی (آبهای روسیه) و نمونه های سواحل گلستان اختلاف معنی داری مشاهده گردید (P<0.05). با توجه به نتایج بدست آمده و وجود تفاوت ژنتیکی معنی دار بین نمونه ها، می توان عنوان نمود که جمعیت یکسانی از شانه دار وجود نداشته و حداقل دو جمعیت در دریای خزر زیست می نمایند.

کلیدواژه‌ها


عنوان مقاله [English]

Investigation of genetic structure in populations of Mnemiopsis leidyi from north and south of Caspian Sea using RAPE Method

نویسندگان [English]

  • F. Laloei
  • S. Rezvani
  • M. Taghavi
چکیده [English]

The molecular structure in populations of Mnemiopsis leidyi were examined for 200 samples from the south (Guilan, Mazandaran and Golestan provinces) and north of the Caspian Sea. DNA was extracted from M leiydi tissue by phenol-chiorophorm method and its concentration was found at 50 to 10Ong. We used the PCR method using 19 random primers (10bp). The PCR products of samples were accompanied with standard marker (50bp DNA ). To measure fragment size, samples were run on a 1% agarose gel. Ten of the ninteen primers showed polymorphism. Statistical analysis of data was performed using POPGENE software. The avarage genetic variation was 0.189 in total samples and the maximum variation was found in samples from north of the Caspian Sea. Also, The maximume genetic distance was between north of the Sea and Golestan coasts in the south (0.089). The minimum genetic distance was between Mazandaran and Guilan coasts (0.001). The UOGMA dendogram showed two clusters. The samples of Mazandaran, Gui.....